一、综合科（保证金管理科）
负责发展规划、综合协调、智力服务工作；牵头党的建设、党风廉政建设、意识形态、群团等工作；负责文电、会务、机要、安全、文书档案等中心日常运转工作；负责信息宣传、保密、政府信息公开、信访、应急、目标绩效管理等工作；负责机构编制、组织人事、工资管理、教育培训等工作；参与相关法律、法规、政策宣传及重大问题调查研究；完成中心交办的其他工作。
负责贯彻执行公共资源交易保证金相关政策法规；负责公共资源交易保证金的代收、代退工作；负责财务管理、中心采购内控管理、国有资产管理、后勤保障等工作。
二、交易受理科
牵头工程招投标工作，承担与有关行业主管部门的联络协调工作；负责拟订公共资源场内交易工作流程；负责交易项目的进场受理及业务咨询工作，落实项目交易时间及场地安排；负责查验网上商城采购计划资料，查验省平台代理机构比选广安市项目资料；负责政府采购项目成交供应商保证金退还资料审核、送签及上传推送工作；负责政府采购项目结果通知书发放及采购统计工作；负责推送工程项目、非进场交易项目公告、变更公告；负责公共资源交易纸质档案的整理归档、编目、利用及管理工作；负责管理维护科室使用的固定资产；完成中心交办的其他工作。
三、交易编审科
牵头政府采购工作，承担与有关行业主管部门的联络协调工作；牵头政府采购全流程电子化工作；负责政府采购、国有土地和矿权出（转）让、国有产权交易等项目文件编制服务工作；负责承办项目交易公告的初审及发布；负责协助交易监督科及采购人处理采购文件质疑；负责承办交易项目文件和相关交易政策的咨询答疑；负责管理维护科室使用的固定资产；完成中心交办的其他工作。
四、交易组织科
牵头土地使用权和矿业权出让、国有产权交易工作，承担与有关行业主管部门的联络协调工作；负责工程招投标项目、政府采购项目评审专家抽取工作；负责开标前资料准备及开标室安排；负责代理机构进场资料查验、项目登记、工作牌发放工作；负责组织开标，管理开标现场秩序及答疑；负责不见面开标工作；负责组织土地使用权和矿业权招拍挂工作，按规定发布结果公告；负责国有产权电子竞价项目交易见证书制作、发放工作；负责交易组织环节交易数据统计；负责管理维护科室使用的固定资产和开标场地设施设备；完成中心交办的其他工作。
五、交易评审科
负责评标室安排及评标现场管理服务工作；负责评审专家身份查验登记工作；负责评标资料整理传递及现场答疑澄清联络工作；负责组织质疑项目专家复核工作；负责异地远程评标工作；负责评审结果信息登记工作；负责政府采购项目、工程项目交易结果公告制作、送签、发布；负责工程项目中标通知书的编制、发放工作；负责非中标（成交）候选人保证金退还资料制作、送签、推送工作；负责协助业主整理工程自主招标项目书面报告；负责评审环节交易数据统计；负责评标资料整理、移交工作；负责管理维护科室使用的固定资产和评标场地设施设备；完成中心交办的其他工作。
六、交易监督科
负责项目质疑资料受理审核工作，按政府采购委托代理协议约定牵头处理各类质疑、投诉及回复工作；因质疑等导致交易结果改变的，负责按规定出具取消中标通知书、递补中标通知书，发布结果更正公告；负责根据财政部门要求对有投诉的政府采购项目作出说明并提供相关资料；负责交易流程各环节责任监督，协助处理现场质疑、投诉，维护正常交易秩序；负责管理监控室秩序，管理维护监控设施设备；负责内控审计，参与内部日常监督、信访和举报处理；负责网上信息公开行为规范；负责管理维护科室使用的固定资产；完成中心交办的其他工作。
七、信息技术科
负责网络、信息化系统规划建设和技术支持工作；负责与有关行业主管部门的联络协调工作；负责公共资源交易全流程电子化建设，为全流程电子化交易、不见面开标、异地远程评标提供技术支持和系统服务；承担全市电子交易平台系统的建设、管理、维护工作；负责机房管理工作，管理维护机房设施设备；负责门户网站管理和网络安全工作，建立网络安全运行机制；承担信息化设备、网络设备、监控设备运维技术指导工作；负责公共资源交易平台运维商、CA数字证书企业入场服务和日常管理相关工作；负责交易数据汇总编报工作；负责依据标准文件开发电子招投标系统；负责音视频电子档案（含监控视频刻录存盘）归集和管理调阅工作；负责管理维护科室使用的固定资产；完成中心交办的其他工作。